RNAdvance Tissue試劑組的性能和數據

從組織中萃取總 RNA

RNAdvance Tissue 試劑組是基於 SPRI 磁珠技術的核糖核酸 (RNA) 萃取試劑。它能夠從各種組織中萃取總 RNA,而不受有機溶劑的危害以及廢物清除問題的影響,也不涉及真空過濾和離心程序等既耗時又耗力的操作步驟。可以使用 2 mL 管或 96 孔盤手動操作,或在貝克曼庫爾特 Biomek  液體處理工作站進行 96 孔盤自動化操作。通過以下數據得出,其萃取過程產生的總 RNA 回收率高於傳統的管柱萃取法的試劑組。

  • 與PCR相關 的下游應用兼容
  • 從多種組織類型中萃取並純化高質量 RNA
  • 有效去除基因體DNA 和其他污染物

在不犧牲純度的情況下,從多種組織類型中高回收 RNA

Genomics RNAdvance Tissue Total RNA YieldGenomics RNAdvance Tissue Total RNA Purity使用 RNAdvance Tissue 試劑組和其他市售競爭試劑組從 10mg 的大腦、肝臟、肺、腎臟或尾組織切片中萃取 RNA。在圖1(上圖)中,使用NanoDrop(Thermo Fisher Scientific)進行對 RNA 定量。採用 RNAdvance Tissue 試劑組從五種不同組織類型中回收的 RNA 量高於其他市售競爭試劑組在相同條件下的 RNA 萃取產量。在圖2(上圖)中,使用 NanoDrop(Thermo Fisher Scientific)評估樣品的純度。對於所有組織類型,RNAdvance Tissue 試劑組以 A260/280 的比值滿足需求。 

 

卓越的 RNA 萃取質量

使用 RNAdvance Tissue 試劑盒從 10mg 腦組織中提取 RNA,並通過 Agilent 2100 生物分析儀Eukaryote Total RNA Nano chip 分析。在下圖 3 和圖 4 中,顯示了從腦組織中提取的兩種 RNA 峰圖。RIN 值大於 9,表明已回收高質量且完整的 RNA。

Genomics RNAdvance Tissue RIN Score Figure 3Genomics RNAdvance Tissue RIN Score Figure 4

 

RNAdvance Tissue 試劑組可提供適用於下游 PCR 應用的 RNA

透過 qPCR 評估擴增 DNA 的能力。採用引子(正向引子 5’-ggacttcgagatag-3’ 和反向引子5’-agcactgttgcgtacag-3’)擴增 (β)-actin 基因(ActB)的第 4 個和第 5 個外顯子,產生 327bp 擴增子。在圖5(下圖)中,無 RT 對照還表明了可干擾下游 RNA 應用的 DNA 去除。在圖 6(下圖)中,使用 RNAdvance Tissue 試劑組萃取的 RNA 可擴增,表明該試劑組去除了 PCR 抑制劑。這些結果表明所萃取的 RNA 可用於在下游 PCR 應用。

Genomics RNAdvance Tissue RIN Score Figure 5Genomics RNAdvance Tissue RIN Score Figure 6

與管柱萃取法的競爭試劑組相比,採用 Genomics RNAdvance Tissue 試劑組可在更少的移液操作下用更短的時間從樣品中萃取 RNA

圖 7(下圖)表示使用 RNAdvance Tissue 試劑組或管柱萃取法的競爭試劑組萃取 1 至 96 個樣本的 RNA 的總耗時。從 20 個樣本的組織內萃取 RNA,較之於相同條件下其他同類競爭試劑組,採用 RNAdvance Tissue 試劑組總耗時更短。在圖 8(下圖)中,在處理 1、8、24、48 和 96 個樣本時操作移液器操作的總次數(包括加樣、混合和丟棄Tip等)。與管柱萃取法的競爭試劑組相比,在處理 8 個樣本以上的情況時,採用多通道移液器涉及的移液器操作明顯較少。

Genomics RNAdvance Tissue Total Time Figure 7Genomics RNAdvance Tissue Pipette Actions Figure 8

RNAdvance Tissue 試劑組工作流程視圖

Genomics RNAdvance Tissue Workflow 

     

     

     

     

     

    1. 在裂解緩沖液和蛋白酶 K 中裂解組織

    2. 將 RNA 與磁珠結合

    3. 將磁珠與雜質分離

    4. 用洗滌緩沖液和 70% 乙醇清洗磁珠,去除雜質

    5. 使用 DNase I 處理樣品

    6. 用洗滌緩沖液將 RNA 重新結合到磁珠中

    7. 用 70% 乙醇清洗磁珠,去除雜質

    8. 從磁珠中洗脫 RNA

    9. 轉移到新的孔盤

     

    根據批次大小或整體實驗通量所涉及的手動操作或自動化方法的應用

    採用 RNAdvance Tissue 試劑組進行 8、24 和 96 個樣本的組織 RNA 萃取所需的預估動手耗時和總耗時(以小時計數)。該萃取工作可在液體處理系統上手動或自動執行。自動化的耗時是 Biomek i5 多通道 96 基因組工作站上執行時間。顯示手動和自動化之間的耗時差異(NR 指“不推薦”)。

    RNAdvance Tissue Manual Automated
    Batch Size 8 Hands-on-Time 0.08 0.25
    Total Time 1.00 2.50
    24 Hands-on-Time 0.11 0.25
    Total Time 1.10 2.50
    96 No DNase Treatment Hands-on-Time NR 0.25
    Total Time NR 2.00
    96 Hands-on-Time NR 0.25
    Total Time NR 2.50

     

    用於從組織中萃取 RNA 的 RNAdvance Tissue 試劑產品

    RNAdvance Tissue 系列試劑組根據您的實驗通量需求提供三種規格。點擊下方任意一個產品貨號進行購買或詢價。想要瞭解更多信息,請瀏覽我們關於 RNAdvance Tissue 試劑盒用於組織 RNA 萃取的相關網頁。

    PART # NAME PREPS
    A32645 RNAdvance Tissue Kit 50
    A32649 RNAdvance Tissue Kit 96
    A32646 RNAdvance Tissue Kit 384

     

     

    * 未用於或驗證用於疾病或其他條件的診斷
    *貝克曼庫爾特,特有標識,和貝克曼庫爾特產品和服務標誌,這裡提到的是貝克曼庫爾特公司在美國和其他國家的商標或註冊商標。所有其他商標歸屬於相應的所有者公司。

     

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